Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Snx15Q91WE1 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms