Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Setd3Q91WC0 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd3Q91WC0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd3Q91WC0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd3Q91WC0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd3Q91WC0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd3Q91WC0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd3Q91WC0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd3Q91WC0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Setd3Q91WC0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms