Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smg8Q8VE18 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms