Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ubxn4Q8VCH8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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