Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BbxQ8VBW5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BbxQ8VBW5 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms