Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2C8

Vmn1r18, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r18Q8R2C8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vmn1r18Q8R2C8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Vmn1r18Q8R2C8 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Vmn1r18Q8R2C8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r18Q8R2C8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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