Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Impg1Q8R1W8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms