Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
CipcQ8R0W1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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