Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Fcho1Q8K285 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Fcho1Q8K285 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Fcho1Q8K285 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Fcho1Q8K285 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Fcho1Q8K285 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Fcho1Q8K285 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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