Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sde2Q8K1J5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sde2Q8K1J5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms