Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rasgef1bQ8JZL7 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms