Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cog3Q8CI04 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms