Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Hpf1Q8CFE2 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Hpf1Q8CFE2 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Hpf1Q8CFE2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Hpf1Q8CFE2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hpf1Q8CFE2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Hpf1Q8CFE2 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hpf1Q8CFE2 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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