Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc28aQ8CEI3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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