Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc17Q8CE13 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc17Q8CE13 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms