Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB19

Phtf2, Putative homeodomain transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf2Q8CB19 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phtf2Q8CB19 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms