Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7W7

Dclre1b, 5' exonuclease Apollo, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclre1bQ8C7W7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Dclre1bQ8C7W7 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms