Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hdac7Q8C2B3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms