Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0L9

Gpcpd1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpcpd1Q8C0L9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Gpcpd1Q8C0L9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpcpd1Q8C0L9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms