Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccser1Q8C0C4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccser1Q8C0C4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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