Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp43Q8BUM9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp43Q8BUM9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp43Q8BUM9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp43Q8BUM9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp43Q8BUM9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp43Q8BUM9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp43Q8BUM9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Usp43Q8BUM9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp43Q8BUM9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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