Protein–RNA interactions for Protein: Q8BS39

Ccdc32, Coiled-coil domain-containing protein 32, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc32Q8BS39 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ccdc32Q8BS39 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccdc32Q8BS39 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ccdc32Q8BS39 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc32Q8BS39 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc32Q8BS39 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc32Q8BS39 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc32Q8BS39 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc32Q8BS39 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc32Q8BS39 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc32Q8BS39 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc32Q8BS39 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc32Q8BS39 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc32Q8BS39 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc32Q8BS39 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc32Q8BS39 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc32Q8BS39 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc32Q8BS39 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc32Q8BS39 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc32Q8BS39 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ccdc32Q8BS39 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms