Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gtf3c4Q8BMQ2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gtf3c4Q8BMQ2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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