Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLY1

Smoc1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smoc1Q8BLY1 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smoc1Q8BLY1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smoc1Q8BLY1 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms