Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms