Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
ChfrQ810L3 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ChfrQ810L3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms