Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Smim19Q80ZU4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Smim19Q80ZU4 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
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