Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y73

UPF0722 protein C11orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q80Y73 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q80Y73 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q80Y73 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q80Y73 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q80Y73 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q80Y73 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q80Y73 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q80Y73 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q80Y73 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q80Y73 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q80Y73 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q80Y73 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q80Y73 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q80Y73 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q80Y73 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q80Y73 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q80Y73 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q80Y73 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q80Y73 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q80Y73 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q80Y73 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q80Y73 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q80Y73 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Q80Y73 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q80Y73 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q80Y73 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q80Y73 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q80Y73 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q80Y73 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q80Y73 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q80Y73 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q80Y73 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q80Y73 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q80Y73 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q80Y73 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q80Y73 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q80Y73 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q80Y73 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q80Y73 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q80Y73 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q80Y73 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q80Y73 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q80Y73 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q80Y73 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q80Y73 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q80Y73 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q80Y73 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q80Y73 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q80Y73 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q80Y73 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q80Y73 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q80Y73 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q80Y73 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q80Y73 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q80Y73 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q80Y73 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q80Y73 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q80Y73 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q80Y73 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q80Y73 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q80Y73 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q80Y73 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q80Y73 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q80Y73 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q80Y73 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q80Y73 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q80Y73 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Q80Y73 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Q80Y73 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q80Y73 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Q80Y73 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q80Y73 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms