Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Zbed4Q80WQ9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Zbed4Q80WQ9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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Zbed4Q80WQ9 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Zbed4Q80WQ9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Zbed4Q80WQ9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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Zbed4Q80WQ9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Zbed4Q80WQ9 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms