Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Polr2eQ80UW8 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms