Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pja2Q80U04 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pja2Q80U04 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms