Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
NischQ80TM9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
NischQ80TM9 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
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