Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Lamp3Q7TST5 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Lamp3Q7TST5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Lamp3Q7TST5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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