Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tnfsf18Q7TS55 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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