Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Snd1Q78PY7 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms