Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rph3alQ768S4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Rph3alQ768S4 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms