Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Topbp1Q6ZQF0 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms