Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp34Q6ZQ93 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp34Q6ZQ93 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms