Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ06

Cep162, Centrosomal protein of 162 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep162Q6ZQ06 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cep162Q6ZQ06 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cep162Q6ZQ06 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cep162Q6ZQ06 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cep162Q6ZQ06 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cep162Q6ZQ06 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cep162Q6ZQ06 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cep162Q6ZQ06 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cep162Q6ZQ06 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep162Q6ZQ06 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep162Q6ZQ06 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep162Q6ZQ06 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep162Q6ZQ06 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep162Q6ZQ06 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep162Q6ZQ06 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep162Q6ZQ06 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep162Q6ZQ06 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep162Q6ZQ06 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep162Q6ZQ06 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep162Q6ZQ06 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep162Q6ZQ06 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep162Q6ZQ06 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep162Q6ZQ06 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep162Q6ZQ06 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep162Q6ZQ06 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep162Q6ZQ06 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms