Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAR7

Ssxb10, MCG68110, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb10Q6XAR7 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ssxb10Q6XAR7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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Ssxb10Q6XAR7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ssxb10Q6XAR7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ssxb10Q6XAR7 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ssxb10Q6XAR7 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ssxb10Q6XAR7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Ssxb10Q6XAR7 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ssxb10Q6XAR7 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Ssxb10Q6XAR7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ssxb10Q6XAR7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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