Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NfrkbQ6PIJ4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NfrkbQ6PIJ4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NfrkbQ6PIJ4 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms