Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
SvoplQ6PDF3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms