Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Smchd1Q6P5D8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms