Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1C6

Lrig3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig3Q6P1C6 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Lrig3Q6P1C6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrig3Q6P1C6 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms