Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gpbp1l1Q6NZP2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms