Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt39Q6IFX4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt39Q6IFX4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms