Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

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Length 452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Krt42Q6IFX2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Krt42Q6IFX2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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