Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Pdzrn3Q69ZS0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Pdzrn3Q69ZS0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Pdzrn3Q69ZS0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Pdzrn3Q69ZS0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Pdzrn3Q69ZS0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
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Pdzrn3Q69ZS0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pdzrn3Q69ZS0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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