Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD7

Fnip1, Folliculin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fnip1Q68FD7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fnip1Q68FD7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms