Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc18Q640L5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc18Q640L5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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